期刊新风向标?简单粗暴的SCI期刊“被踢指数”出炉

3月份科睿唯安官方一口气剔除大量期刊的突发事件至今在科研界尚有“余震”,这些期刊中影响因子高达7.31的Oxidative Medicine and Cellular Longevity也无法幸免被剔除的命运,因此,很多科研人对于期刊判定的标准感到更加疑惑了,究竟哪些期刊会被剔除?

除了我们之前介绍过的on hold标记外,近期CAR index (jcarindex.com) 这个国外公益网站也推出了新的评定标准——CAR index期刊“被踢指数”,用来检验杂志的学术诚信风险。网站根据CAR指数高低分级,把低于5%设定为低风险,5-10%为中风险,大于10%为高风险。

CAR index,即Comprehensive Academic integrity Risk index(综合学术诚信风险指数)。CAR官方宣称该指数将用于预测期刊被SCI排除的风险,可以帮助出版商监控期刊,也可以帮作者更好的选刊。具体的计算公式及评定标准如下:

从上述公式可见,CAR指数=该期刊撤稿数(R)+被曝光数(P)+图片重复文章数(F)的总和,除以当年年度发文量(N)的比值。

该公式中,分子部分为论文相关的负面数据,这些数据的总和越大,诚信风险也就越大。分母部分则是该期刊当年的发文量,分母越大但分子保持不变,期刊风险比率就越低。

网站根据CAR指数高低分级:

  • 低于5%设定为低风险
  • 5-10%为中风险
  • 大于10%为高风险

同时,网站用该计算方法对35本被踢期刊进行了详细分析验算,发现:在被剔除的32本期刊中(3种期刊因为停刊而被踢),多达19本期刊2022年的CAR指数或2023年的实时CAR指数超过10%,占比达到60%!在纳入“发表的文章是否超出期刊范围”时,除Revista Brasileira De Medicina Do Esporte为7%,中风险外,所有32种期刊的22年CAR指数或23年的实时CAR指数均大于10%。

期刊是否最终被科睿唯安剔除,除了期刊学术诚信风险,官方肯定会综合考虑,比如文章质量(不暴雷不等于文章质量好),自引率等等。

但不管如何,CAR指数作为目前唯一一种评价期刊学术诚信和预测“被踢风险”的指标,在我们平时选刊投稿时,都可以作为重要参考。而在今后的期刊解析栏目中,我们也会为增加其看的CAR指数分析这一项,供大家更多维度的衡量期刊是否值得投递。

本文于2023年3月28日发表于Physical Chemistry Chemical Physics,封面图由麦德辑团队负责设计

文献信息
An, Y., Ouyang, M., Kong, S., Wang, G., & Chen, X. (2023). Electronegativity principle for hydrogen evolution activity using first-principles calculations. Physical Chemistry Chemical Physics.
DOI:doi.org/10.1039/D2CP060

期刊信息
IF:3.945
JCR分区:PHYSICS, ATOMIC, MOLECULAR & CHEMICAL-Q1;CHEMISTRY, PHYSICAL-Q2
中科院分区:大类化学二区;小类物理:原子、分子和化学物理二区、物理化学三区

多相催化剂的催化活性通常用分子/质子吸附能ΔGH作为热力学描述符来描述。然而,由于在反应过程中缺乏电荷传递信息,该描述符无法定量跟踪反应速率。离子受到较大的分散,许多催化剂偏离了Sabatier的线性依赖性。例如,2H-MoS2-VS(2H-MoS2上的S空位)和Ir在ΔGH上有很小的差异,但在j0上有很大的差异。此外,描述符也不能解释为什么当pH从1变化到13时,一些催化过程在j0中减少了2到3个数量级。
暨南大学陈晓波教授团队采用密度泛函理论(DFT)计算,结合正则和大正则系综来研究反应条件下反应势垒和电化学界面电荷转移之间的定量关系。通过对各种贵金属和化合物的分析,发现HER势垒与催化剂的电荷转移能力成反比,这可以用Mulliken电负性来定量描述。这种电负性原理被证明是所有HER催化剂的路径无关和普遍的。报告了反应动力学与析氢反应(HER)的反应动力学和界面电荷转移之间的正相关关系。并且HER催化剂的Sabatier关系在正则计算中表现出较大的分散,但在大正则系综下线性度有所改善,表明表面电荷确实是重要的。

该研究中,研究人员使用DFT计算来研究了支配HER动力学的电荷机制。HER势垒与反应质子对的电子数成反比,说明更有效的电荷转移可能会诱导更高的催化活性。在正则计算中,Sabatier依赖表现出较大的分散,但在大正则系综下线性有所改善,证明表面电荷确实是重要的,这种电负性原理就可以作为催化剂设计的指导方针。

计算方法

在这项工作中,通过VASP量子计算软件包的PAW赝势进行正则系统的第一性原理理论计算,同时利用optB86b交换相关函数来描述范德华(vdW)相互作用。本文使用无水模型采用了PBE函数计算ΔGH和Mulliken电负性,使用JDFTx代码和CANDLE溶剂化模型进行了大规范总能量计算,位移和最大力移的收敛率分别设置为0.02 Å和0.02eV/Å,截断能为500 eV。

傻傻分不清楚?详细盘点SCI论文中那些容易被混淆的部分

我们都知道SCI论文写作是由结构模板的,一般一篇完整的论文会包含:Title(标题)、Abstract(摘要、Introduction/ Background(前言)、Material and Method(材料与方法,即实验报告部分)、Result(结果)、Discussion(论证)、Reference(引用)、Acknowledgement(致谢)等部分。对很多作者,尤其是小白新手来说,在实操中会发现很难理解SCI论文中某些部分之间的区别,也不确定它们是可以互换的还是有不同的用途。今天我们就来综合解析一下,供大家日常写作中甄别。

01、Abstract & Introduction的区别

Abstract是对论文的总体概括,通常包含研究结果、方法、结论等精华信息。对于时间有限的科学家来说,这一小截摘要是他们判断文章是否可读的线索,也是读者考量付费文章的指标。此外,期刊编辑也会根据摘要来决定论文是否送审。

Introduction/Background则是放在文章开头,交代研究背景,有助于读者理解研究动机。具体来讲,作者要依次阐明研究主题,综述相关文献,讨论现有研究的不足,引出研究问题,最好再以研究目标结尾。

摘要既要概括文章的主要内容,又要让读者产生读下去的兴趣。而引言则为研究问题提供详细的背景说明,方便垂直领域以外的读者理解。从结构上来看,摘要中包含的研究方法和结果两部分内容是引言中没有的。

02、Aim & Objectives的区别

首先从定义上来说,Aim指的是长期目标,是指一个远大的目标;Objective是短期的,指具体的,组成一个aim的小目标,为实现aim的具体步骤,通常不止一个。

Research Aim是你为什么要做这个研究,即问题的提出,是研究的意义与理由。写一篇dissertation或proposal时,只需要定好一个大的aim(宏观目标)。

Research Objective是指具体的要达到的目的,如通过研究构建某种研究模式、研究策略、方法,获得某某规律,揭示某某机理等等。你为了达到你的目标(Aim)要走哪些具体步骤。你要通过表述“怎么去做”来让你的课题丰满具体。

以适当的方式制定研究目的和目标是论文最重要的方面之一。这是因为研究目的和目标决定了研究的范围,深度和总体方向。研究的问题即整篇论文的核心问题,必须根据研究结果予以一一的回答。

03、Introduction & Problem Statement的区别

Introduction这个部分相对简单,你只需要说明以下三个问题:研究领域是什么;为什么要选择这个领域;研究对这个领域有多重要。

Problem Statement主要是问题陈述,在介绍完研究领域以后,现在需要描述在研究领域中你要解决的具体问题,不过你不能上来就说问题是什么。

简言之Introduction主要是阐述研究的背景信息,而Problem Statement则是基于此领域的背景信息后,找到的研究空白或者需要解决的问问题。

再一个区别就是就两者的写作顺序而言,Problem Statement写于研究早期,通常在选定研究领域之后。而Introduction则是在研究完成后的论文写作中完成的。

04、Introduction & Background的区别

有的期刊会要求撰写Introduction和Background之一,有的要求两者都要,我们引用Nurse Author & Editor上一篇题为“I Say ‘Introduction’; You Say ‘Background’”的文章,来为大家解析一下二者的区别。

Introduction通常占论文总字数的10-15%,例如,如果你的论文总字数是3000,那么你应该把Introduction定在400个字左右。通常建议在完成论文的其他部分后编写论文的Introduction部分。这是因为在看到论文大局之前,很难弄清楚在论文的Introduction部分到底要放什么内容。Introduction主要涵盖的内容应该是:阐述这项研究为何重要,研究内容和目的。

Background则主要是阐述我们具体研究内容的地方。从本质上看,Background部分可以看作是一个简单的文献综述(并非系统的文献综述)。Background我们就要合理地选择相关的文献来佐证我们研究的合理性,文献必须与研究主题密切相关又要承上启下,保证逻辑性。

简而言之,Introduction和Background的区别在于Introduction内容较宽泛、不需要太多参考文献,主要体现研究的大背景或大方向,而Background则较具体,相当于一篇小综述,与所进行的研究密切相关。

05、Results & Discussion的区别?

由于Results和Discussion都是展现研究成果的部分,因此很容易混淆。

就内容来说,Results部分主要是对应method部分所产生的研究结果,应包括对研究结果的简要解释,并以表格、图表或其他非文本元素提供的数据作为支持。

而Discussion部分主要是回答这些问题:Results中的数据表明了什么规律?是什么样的原因导致了数据的这个走势?这个趋势说明了什么问题?预示着未来有什么变化?你是不是排除了一些不好的数据?为什么?这种研究方法的缺点是什么?改进空间?

也正是由于这两部分既区别有密不可分的关系,近年也有很多讨论两者究竟是合并写作为 “Results and Discussion”,还是各自作为独立版块进行阐述的探讨。那么,我们也在此总结一下合并写作和分开写作的优缺点

Results和Discussion两者结合

优点:适合各个分论点是并列关系的论文;数据分析后马上接入分析,读者和审稿人阅读体验较强;文章结构的连贯性更强更有代入感。

缺点:分析与数据混合、比较笼统,强调不够就容易让读者或审稿人忽略重要结论或信息;容易让审稿人和读者忽略论文的研究意义。

Results和Discussion两者分开

优点:适合各个分论点是对比或者层次关系的论文,单独的分析章节让各个部分的分工更加明确思路更加清晰;分析更加深入,从而与实际结合更加紧密

缺点:Discussion部分有可能重复results中的内容,增加文章篇幅写作难度和对内容分析总结的要求相对要高一些。

06、Results & Conclusions的区别

Results即实验的结果。这一部分主要是呈现论文的研究数据结果。此部分的撰写要点则是围绕先前的材料与方法部分所提及的实验顺序,来逐一阐述并总结各实验的数据结果。

而Conclusions是论文整体的概括总结,诸如要重新强调研究主题及其重要性,再次声明主要论点并简述如何得到这些论点的过程,尤其指运用了哪些方法、视角等。指出研究结果怎样回应前文前言提出的研究问题,点明在哪些方面扩展了现有研究,还有概述整个研究的局限,以及日后可以开展哪些方面的工作。

就读者而言,通常情况下,读者尤其是编辑或审稿人在阅读某篇论文时,会先看标题、摘要、引言,再看结论。一般阅读完这几个部分,就已经决定了他们会不会再继续阅读论文正文。作为论文的归宿,结论起着画龙点睛的作用。

Results的内容一般包括实验或观察的数据、效果等;Conclusions的内容一般是通过结果分析得出的主要结论或推断,以及建议等。

07、Footnotes & Endnotes的区别

通常,Footnotes 是在给定页面底部找到的注释或文本,而Endnotes是文本末尾的注释。有些人将文本末尾的注释称为“Footnotes ”,但页面底部的文本从不称为“Endnotes”。

Endnotes的定义“放置在文本末尾的注释”。这个词的定义几乎没有语义上的歧义,它的使用方式相当一致。

而Footnotes 的定义就有点复杂了,因为这个词有多种含义,其中第一个定义是“通常放置在印刷页面上文本下方的参考、解释或注释注释”。之所以说注释“通常”放在页面底部,而不是“总是”,是因为有时人们将书末的注释称为Footnotes ,而不是Endnotes。

而第二种,Footnotes 也有比喻意义,包括“相对从属或次要的部分(如事件、工作或领域)”和“用于说明或解释的东西”。

熟读这份SCI作图规范,离CNS又近了一步!

论文创作完毕后,投稿之前按照期刊作者指南中的规定来调整好格式,是重中之重的一环。毕竟编辑审稿第一眼就是看你的文章符不符合格式要求。而这其中最费劲的莫过于Figures了,各大期刊对于图片的要求往往十分具体,分辨率、字体格式、颜色模式等等。今天我们就汇总了CNS三大顶刊的作图规范标准,以供大家参考。

论文的Figure包含哪些内容?

首先我们来了解一下论文的Figure通常包含哪些要素,然后才能对应按格式进行制作修改。我们前几期讲过的位图、矢量图等格式,都是针对的Figure中的图片部分,但除了图片,Figure中还包含图片的顺序编号以及图片必要的英文说明,其他常见的还有统计标识(比如“*”,或者直接标注p值)、显微镜图片的放大倍数(比如“40X”表示放大40倍)等等。

如下面这张图所示:

Nature

Nature投稿指导指南中的Figure要求包括基本图表要求(General Figure Guidelines)和终稿图表要求(Final Figure Submission Guidelines)两个部分,其中图片包括两种类型:

1.使用设备或者仪器拍摄采集的图片,包括显微镜、扫描仪及摄像机等所拍照片;

2. 由数据先绘制成图表、再导出生成的图片,主要包括各种点线图、柱状图、饼图和各种统计图等。

与手稿一起提交待审的图像只能做最低限度的处理(如在显微照片中添加箭头)。作者要注意保存未处理的数据和元数据文件供编辑评估稿件之用,否则审稿进程可能被拖延。终审提交的数字化图像必须保证高质量,分辨率至少为色彩300 像素、灰度600像素、线条1200像素。

对于某些实验、领域和技术来说,一定程度的图像处理不可避免,但最终获得的图像必须正确表示原始数据且符合道德标准。以下准则可以帮助大家在图像处理的基础上准确展示数据:

  • 作者应列出所有使用过的图像采集工具和图像处理软件包,并在方法中记录关键的图像收集设置和处理操作。
  • 在不同时间或不同地点收集的数据不应合并于同一图像中,除非所得图像来自于时间平均数据或延时序列;如果必须并置图像,应在图中明确划分边界,并在图例中说明。
  • 避免使用修补工具(如Photoshop中的克隆和修复工具)或任何故意掩盖图像操作的功能。
  • 改变亮度和对比度等处理只能均匀应用于整个图像(并同时应用于对照组),不应调整对比度以抹除数据;避免过度操作(如以牺牲其它区域为代价突出图像中的某个区域或有偏向性地设置阈值)。

提交修改后的最终数据时作者可能会被要求提交原始的、未经处理的图像。

显微镜使用

作者应准备好原始数据,按要求向编辑提交,并按收集到的分辨率提供图像来源。来自多个区域的细胞不应并置于同一区域,否则应在补充信息中说明。

具体指导原则:图像的调整应适用于整个画面,避免阈值操作、改变信号范围等。如使用了“伪着色”和非线性调整(如“伽马变换”),必须公开说明。在“合并”的图像上,个别颜色通道的调整有时是必要的,但应在图例中说明。

我们建议将以下内容与最终修订版的手稿一起发表:

  • 设备类型(显微镜/物镜、照相机、检测器、过滤器模型和批号)和采集软件要列举在方法中,虽然仪器间存在差异,但关键测量设备的设置也应列出。
  • 命名为“设备和设置”的补充方法文件(或作为“方法”的一部分),列出每幅图像的:时间和空间分辨率数据等采集信息(xyzt和像素尺寸);图像色彩深度;温度、成像媒介等实验条件;荧光剂(激发和发射波长或范围、过滤器、二色分束器)。
  • 显示查找表(LUT)以及LUT与位图之间的定量地图,特别是在使用彩虹伪色时;如果LUT为线性且涵盖了所有数据范围,则应进行说明。
  • 处理软件的名称和操作 (如反褶积类型、三维重建、表面和体绘制、“伽马变换”、阈值和投影)。
  • 获取图像的测量分辨率,增强图像分辨率的任何下游处理或平均处理。

电泳凝胶和印迹

阳性和阴性对照及分子尺寸标记基因应包含在每个凝胶和印迹中,无论是在主图或扩展数据补充图里。对于先前表征过的抗体必须提供引用;对于在研究系统中未能很好地表征的抗体,要详细描述其特异性以及实验中试剂的反应范围,这些描述应该作为补充信息或在抗体档案数据库中公布 (如Antibodypedia, 1DegreeBio)。

如果适当的处理可以提高清晰度和简洁性,那么我们鼓励在论文主体中展示裁剪的凝胶和印迹,但必须在图例中说明。

  • 不建议对不同凝胶(印迹)上的样品进行定量比较,如果这种比较不可避免,则必须在图例中说明样品来自同一实验且凝胶(印迹)是并行处理的;将凝胶中不相邻的条纹并置时,必须清楚勾画出凝胶边界。
  • 裁剪的凝胶必须保留重要条带。
  • 论文主体部分中裁剪过的印迹应在条带上下分别保留至少六个带宽。
  • 不建议提高凝胶和印迹的对比度,因为过曝可能掩盖其余条带;尽量使用灰色背景,如必须使用高对比度则应在补充信息中说明。
  • 定量比较时,应使用适当的试剂、对照和线性信号范围的图像化方法。

Science

1. 准备修订好的图片

为了加快论文发表过程,请按照准备初稿的说明中给出的样式准则,最好将图形创建为基于矢量的文件,例如Adobe Illustrator生成的图形。

将每个图形作为独立文件提交,与手稿文本分开。

2. 图的布局和缩放

图片打印出来的宽度通常应为5.5厘米(1栏)或12.0厘米(2栏)。条形图和简单的折线图可以减小到较小的宽度。符号和文字应足够大,以便在缩小后清晰可见(缩小后的高度大约为7点(2毫米),不少于5点)。单个图片中字体大小不应有过大的差异。

3. 分辨率

不能作为矢量文件使用的线条图在最终打印出的尺寸上应具有至少300 dpi的分辨率。灰度和彩色图在最终打印尺寸下的分辨率也应为至少300 dpi。

4. 格式

修订阶段的图片文件必须采用以下格式之一(按首选顺序):

(1)矢量插图和图表(首选):PDF,EPS,AI

(2)光栅图和图:TIFF(最低300 dpi)

(3)用于拍摄或显微图像的矢量和光栅组合:PDF,EPS

(4)光栅照片或显微图像:TIFF

在当前阶段,我们不接受上述格式以外的文件;特别是Microsoft Word文件中嵌入的图片以及Microsoft PowerPoint文件。

另外请以尽可能高的分辨率保存原始格式的文件,因为Science可能会要求提供这些原始图像。

Cell

一般准则

  • 每个图形应适合单个 8.5寸x 11英寸页面
  • 图表应作为单独的图像文件提交,而不是嵌入稿件中;请不要单独发送图形面板
  • 对于初始提交,Cell更喜欢TIFF或PDF文件,但也会接受JPEG或EPS文件;PDF 文件大小应小于 3 MB
  • 对于最终制作,更喜欢高分辨率的TIFF,PDF或CDX(ChemDraw)文件;每个文件不应超过 20 MB
  • 注意:
  • Cell期刊首选源文件(AI,PSD或PPT)作为前沿图形
  • 如果可能,请在PC而不是Mac上创建并保存ChemDraw文件,因为Mac创建的文件在PC上处理时偶尔可能会丢失某些细节(例如符号),但这些细节期刊会使用到。
  • 对于彩色图表,所需打印尺寸下的分辨率应为 300 dpi
  • 对于黑白图表,所需打印尺寸下的分辨率应为 500 dpi
  • 对于艺术线条图形,所需打印尺寸下的分辨率应为 1000 dpi
  • 确保源文档中的任何光栅图稿都处于适当的最低分辨率
  • 如果使用,颜色应编码为 RGB,并且为了适应所有观看者,不应将红色和绿色一起使用
  • 始终嵌入字体并仅使用 Arial 字体
  • 不同的面板应用大写字母标记
  • 在所需的打印尺寸下,文本应约为 6-8 pt
  • 将插图各部分之间的垂直空间限制为仅视觉清晰度所需的垂直空间
  • 线条粗细或描边宽度应在 0.5–1.5 pt 范围内
  • 灰色填充应保持与其他填充至少 20% 的差异,并且不小于 10% 或深于 80%
  • 使用图层时,请在存储图像之前减少到一个图层(拼合图稿)(日记“单元格”除外))
  • 必须为任何显微照片提供比例尺,而不是放大倍率。

图文摘要准则

此外,Cell期刊还有个图文摘要(Graphical Abstract,GA)的要求,其在参数上和文章图片有差异,但是基本指标是一样的。

技术要求如下:

  • 尺寸:1200 像素,300 dpi
  • 字体:Arial,12-16号;较小的字体在网上将无法辨认
  • 接受的文件类型:TIFF、PDF、JPEG
  • 内容:图形摘要应由一个版面组成

结论相反论文共用同一张图|论文图片处理不当就是学术不端

近些年,国内论文学术不端的重灾区便是“图片处理”问题,很多科研工作者也会疑惑,正常的图像数据处理和科研图片造假之间的界定范围究竟是什么?我们在日常的科研工作中又该如何避免误踩“图片造假”的雷区呢?今天我们就来探讨一下论文图片处理的相关细节问题。
近期,广东省第二人民医院某团队两篇结论完全相反的文章共用了一张论文图片的“荒唐事”被热议。这篇发表在International Journal of Oncology 上题为“Single-walled carbon nanohorn aggregates promotes mitochondrial dysfunction-induced apoptosis in hepatoblastoma cells by targeting SIRT3”的文章与该团队同年发表在Journal of Nanoscience and Nanotechnology的文章“SWNHs (Single-Wall Carbon Nanohorns) Supervises Endoplasmic Reticulum (ER) Stress in Hepatocellular Carcinoma”,肿瘤图似乎基于相同的一个实验,在两篇论文中分别用作图5B和图1A,显示了相同的18个肿瘤和小鼠。但两篇文章得出了完全相反的结论。截至目前,作者作出了回应,表示相关的条带重复可能是研究生滥用了该图像,目前将进行进一步的详细调查。
 

【上】DOI: 10.3892/ijo.2018.4459图5B;【下】DOI: 10.1166/jnn.2018.15457图1A

无独有偶,2018年2月8日,陕西中医药大学Zhu Zhenning在Bioscience Reports 在线发表题为”HOTAIR contributes to cell proliferation and metastasis of cervical cancer via targeting miR-23b/MAPK1 axis“的研究论文,该研究确定了HOTAIR发挥其致癌作用的新途径,并为HOTAIR在宫颈癌预后和治疗中的潜在应用提供了分子基础。2021年6月8日,该文章被撤回,主要原因是该文章的实验样品,标尺及桌布在其他多达10篇文章出现重复使用,同时作者没有回应编辑的询问。
不管有心还是无意,近些年,国内论文学术不端的重灾区便是“图片处理”问题,很多科研工作者也会疑惑,正常的图像数据处理和科研图片造假之间的界定范围究竟是什么?
雷区警惕!!!这样会造成图片相关学术不端
引用不当或重复使用
很多作者往往为了节省时间,会直接引用别人已经发表的数据或者图表,但在引用时未完全理解著作权法规定的“合理引用”的内涵,在引用后不标记出处,或虽然标记了出处但并未获得源文献的版权授权。
而另一种情况是,作者引用自己曾经出版过作品中的图片,认为自己是著作权人,并未获得源文献出版方的授权,或者重复使用自己已出版作品中的图片却未标记出处。
这两种情况都会造成图片引用不当或重复使用的学术造假。
修改使用不当
研究者将来自其他作品的部分图片进行缩放、翻转、旋转、裁切、拼接、像素修改等标示为不同的样品,直接用于自己的实验结果中;或刻意修改重组图的部分内容以得到想要的结果,这也会造成学术不端。
篡改或伪造图片
最严重的图片使用不端行为应该是篡改或伪造实验结果所不能得到的图片,也就是说,论文的图片及其数据并非实验所获得,而是通过操纵实验结果伪造所得。
 
一图毁所有:还有这些问题会导致你的图片被毙掉
图片质量差
这主要是指图片的清晰度很差,比较模糊。绝大多数杂志所接受的图片的最低像素为300dpi,所以制作图片一定要按照这个要求去做。很多杂志所接受的图片格式为JPEG和TIFF,因此保存图片时,除了转换成杂志所要求的格式外,一定要保存原始格式。
图片瞎组合
你的图片中带有文字说明或图片的标题;组织学图片中没有标尺(用放大倍数代替);同一图片的不同部分不是在同一图片中完成,而是用WORD中什么功能进行组合。
图片“误用”
很多作者会对图片进行细微的修改,有时候是为了美观问题或删除假阳性结果。较高影响力的杂志,会要求你提供原始图片。千万不要抱侥幸心态,即使用软件对图片进行了修改,在较高放大倍数下还是能看到涂改痕迹。审稿人比较在意图片的真实性。建议你投稿时提供原始图片,这样更能反映结果的可靠性。
图片比例失调
大家都知道,一个好的图片一定要简洁,照片和文字比例得当,字体一致,图片的可读性高,也就是说,图片在不做处理,放大或缩小的情况下,能看见图片中的所有内容,组织结构除外。然而你的文章的图片出来后效果就是,图和文字比例失调,同一图片不同部分的字体以及大小不一致,同一Figure不同图片的比例不协调等。
 
怎么做?图像处理金标准
对于某些实验、领域和技术来说,一定程度的图像处理不可避免,但最终获得的图像必须正确表示原始数据且符合道德标准。以下准则可以帮助大家在图像处理的基础上准确展示数据:
  • 作者应列出所有使用过的图像采集工具和图像处理软件包,并在方法中记录关键的图像收集设置和处理操作。
  • 在不同时间或不同地点收集的数据不应合并于同一图像中,除非所得图像来自于时间平均数据或延时序列;如果必须并置图像,应在图中明确划分边界,并在图例中说明。
  • 避免使用修补工具(如Photoshop中的克隆和修复工具)或任何故意掩盖图像操作的功能。
  • 改变亮度和对比度等处理只能均匀应用于整个图像(并同时应用于对照组),不应调整对比度以抹除数据;避免过度操作(如以牺牲其它区域为代价突出图像中的某个区域或有偏向性地设置阈值)。
  • 提交修改后的最终数据时作者可能会被要求提交原始的、未经处理的图像。
总的来说,我们在使用科研图片时,我们只要做到以下几点,就能规避“图片处理学术不端”的雷区:
  • 真实永远是第一位!合理化的图像处理只是为了让科研成果的表达更加清晰和形象,区分合理图片处理和图片造假的关键在于是否歪曲事实,只要你的处理是规范、合理且真实的,就不属于学术造假的范畴。
  • 合理处理的原则:在确保原始图片完整性和正确性的基础上,根据研究内容适当裁剪或调整图片大小、颜色、对比度、亮度等,不能只对图中局部内容进行修改,影响实验真实结果的体现,误导读者,更要切忌篡改、伪造或剽窃。
  • 增强版权意识,引用或使用他人作品图片需要先得到他人的授权,重复使用已发表论文中的图片,必须按照我国著作权法第22条规定的“12种合理使用他人作品的方式”,注明出处、完整引用。

国自然标书撰写答疑|研究内容、研究目标、拟解决关键科学问题该如何区分描写

在上个月,2023年度的国家自然科学基金集中申报已经截止,目前大家都在等待形式审查的结果,以及最终8月的放榜。按照以往的经验,形式审查公布的时间一般是4月底,而2023年申请通知中提及的形审结果也提到“基金委将于2023年4月28日前公布申请项目初审结果”,也就是最晚会在下周公布。那么这段等待的时间也不要浪费了,不如一起来学习一下NSFC申请书的撰写技巧。我们都知道:研究内容、研究目标和拟解决的关键问题,这三部分是标书重点阐述内容。但在实际的操作中,这3个内容极易写重复。今天我们就来解析一下三者的区别以及各自的写作技巧、写作要点。
01、区别
研究内容

紧紧围绕研究假说而组织设计的具体、细化的研究框架。研究内容要层次分明,研究方法应用恰当。

研究目标

研究目标作为研究内容的总结性陈述,要求:明确、精炼、合理。 要与研究课题和研究内容相互呼应,避免目标过多。

拟解决关键问题
该部分主要是描述理论上的关键科学问题和技术上的“瓶颈”问题,以及研究过程中,对达到预期目标有重要影响的某些研究内容或因素。除了提出问题,应相应的给出解决方案和对策。 
02、写法
研究内容
研究内容,其实就是阐明这份国自然申请书准备要做什么,以及如何去具体实施并证明你的假说是对的。但是因此研究内容要紧紧围绕研究假说而组织设计的具体、细化的研究框架。撰写研究内容部分,不要写的过于复杂和繁琐,详细步骤要在研究方案中体现。当然,也不能一两句话就结束了!如果使用了新技术、新方法,则可以略微详细一些,同时建议标明参考自哪篇文献,毕竟是新技术、新方法。如果是常规实验方案,那就一句话带过就行。研究内容在设计和取舍时要注意平衡几个原则:
  • 以研究的课题和科学问题为导向,紧紧围绕研究假说展开,紧扣科学问题,与研究目标相互呼应。既要避免内容过于简单,没有深度,又要避免内容“宽泛”而“空洞”,要突出研究重点。
  • 平衡研究内容之间的逻辑关系, 考虑所选的研究内容是否是解决科学问题的最佳可行方案,是否可以充分解决科学问题。
  • 把握好前期研究基础与本课题研究内容的关系,在说明拟开展课题与前期工作具有连续性的同时,注意本研究内容的不同之处。
  • 在项目周期和技术可行的支撑下,要考虑研究内容是否可以顺利完成。
  • 特别注意的是研究方法不等同于研究内容。
研究目标
因内容而生的目标研究目标和研究内容两者是一一对应的关系,所以每写一项研究内容就可以总结一个目的,当研究内容书写完毕,研究目的自然也破壳而出了。研究目标要明确要精炼,与研究内容相呼应;这里再次强调,研究目标就是研究内容所要达到的目的。具体文字呢,也不宜过多,只需要说明,是用来证明我们的研究目的,把科学假说的结果分条目列出来。具体来说可从以下几点进行撰写:

  1. 探讨研究要素在某一组织样品中表达与临床因素之间的相关性,明确其临床意义;
  2. 阐明研究要素在某一科学问题中的作用角色,理解其与临床相关的根源;
  3. 揭示研究要素发挥功能的效应途径,鉴定其调控的信号通路和分子机制;
  4. 研究目标要能在项目名称中得到体现。
拟解决关键科学问题
“拟解决关键科学问题”也就是“科学假说”的另外一个表述方式:是申请人要解决这个关键科学问题。因此撰写时要回头看一下立项依据中的科学假说,然后总结出来“哪些内容是关键科学问题”。拟解决关键科学问题要与创新点相互呼应,要准确写出项目涉及的创新点和难点,体现申请者对项目的理解能力。此部分依然可以按照组织、细胞、动物、分子四个层次来梳理,通过几个不同维度进行研究,相互佐证推导出研究要素是否有功能,通路机制是什么,该机制的解析对于整个项目的科学问题有什么帮助,这几个问题的结论。同时一定要注意,关键科学问题,绝对是申请书中其它任何一个部分都没有出现过的。它不是研究目的,不是研究内容,不是技术手段,不是意义,不是创新点。你写完之后回去看一眼,如果你发现它和之前的任何一部分有重复,那你肯定没有归纳好,建议返回去上面这一步再来一遍。

既要体积小又要够高清|全面解析科研图片压缩要求与技巧

前面几期的科研绘图专题中,我们已经为大家分析了一幅好的插图对论文的重要性。但是在科研图片的处理过程中,可能常常会遇到图片太大超过上传限制,但压缩到合适大小又会变模糊这一情况。那么,如何在减小图片文件体积的情况下不降低图片的精度呢?今天就给大家介绍几种方法。

01、论文配图的基本规范

图片尺寸与格式要求

科研论文组图根据宽度主要分为三种:全版图,宽度约为17 cm;半版图,宽度约为 8 cm;以及 2/3 版图,宽度约为 12-15 cm。单张图片的字体类型一般为 Arial 或 Times New Roman,字体大小需在 6-14pt,线条粗细在 0.25-1.5pt 之间。

图片来源:SCI 插图规范(国际通用版)

图片格式类型

主要分为位图和矢量图两类:

位图:采用矩阵结构来表示,图片放大或缩小均会导致图片变得不清晰,常见的位图格式有:TIFF、JPG、BMP等;

矢量图:采用点、线、多边形的结构来表示,图片缩放不会失真,常见的位图格式有:EPS、WMF、EMF等;

目前多数期刊要求图片格式为TIFF位图或者EPS矢量图,并且通常要求形成独立文件。因此,建议科研图片保存为TIFF位图或者EPS矢量图。

TIFF兼容性好,而且提供预览图,缺点是体积大,但它是论文和书刊等出版物支持最广的图形文件格式,打印出来清晰度特别好;

WMF、EMF是一种矢量图形格式,也称为面向对象的图像或绘图图像,它的特点是放大后图像不会失真,和分辨率无关,文件占用空间较小,适用于图形设计、文字设计和一些标志设计、版式设计等。

JPG是一种常用的有损压缩方案,用来压缩存储批量图片。

分辨率要求

line artwork(纯纯的黑白图,没有中间颜色)。

是要求最高的,需要高达1200dpi以上。

combiantion artwork(halftone artwork与line artwork的组合,或彩色图与line artwork的组合)。

属于中间档,600dpi以上即可。

halftone artwork(颜色深浅有差别的灰度图,也就是我们最常用的形式)。

要求最低,300dpi以上即可。

了解了图片的基本要求和不同格式类型后,我们来看看基本的调整方法

02、调整方法一:Photoshop调整

这张bmp格式的图片有17.4M,显然大小和图片格式都不太符合期刊要求。我们现在先利用最基础的photoshop软件来调整它。

调整图片尺寸

首先我们点击菜单栏“图像-图像大小”(快捷键Ctrl+Alt+I)来调出图像大小面板

然后更改一下宽度、高度的单位,将像素更改为厘米

此时可以看到图片宽度远远超出了期刊要求的全面幅宽度17厘米,那么我们将其更改为17厘米。注意更改前需要勾选约束长宽比例按钮,这样才能保证长宽同时调整适配,避免图片变形。

调整图片分辨率

然后将图片分辨率调整为期刊要求的300dpi

输出设置

点击确定后,选择“文件-存储为”,存储格式改为tiff格式

图像压缩模式选择LZW。如果源文件中包含多层图层会导致图片体积变大,如果此时图片已经定稿不需要再修改,我们可以将图层压缩模式选择为“扔掉图层并存储拷贝”,这样能进一步缩小图片文件体积。

可以看到更改后的图片大小变为了1.5M。且我们放大对比两图,清晰度上无差。

(上图为tiff格式,下图为调整前的bmp格式)

03、调整方法二:利用在线图片压缩工具

Recompressor

Recompressor是一个图像压缩在线工具,它能在文件内存大小和画质之间找到平衡,让图片降低内存的同时保留原有的画质清晰度。

官方网址:recompressor.com/

打开网站后将需要压缩的图片直接拖拽至选框内,网站会自动对图片进行多种内存大小格式压缩,以图表的形式总结不同压缩条件给图片带来的影响,并给出最佳的压缩建议,直观对比压缩效果。所有压缩结果都可以免费下载。具体的使用教程可以参考我们的往期视频号内容。

Picdiet

Picdiet网站是一款在线批量压缩图片神器,可以免费批量压缩图片,所有操作都是在浏览器本地进行,不会将图片传输到网站的服务器,所以不用担心隐私问题。压缩效果立竿见影,杠杠滴。Picdiet网站采用独特且强悍的JavaScript算法,能极速压缩80%的图片体积,而不损害其质量。网站不需要后端服务器或者API的支持,仅通过你的浏览器来压缩图片大小,这意味着它压缩图片极快并且不会导致隐私或敏感图片泄漏给第三方。同时我们大量的测试结果也证明其压缩表现要远好于常规的压缩软件如:jpegoptim,jpegtran,jpegrescan。完全免费。

网址:picdiet.com/zh-cn

imagesTool

imagesTool网站目前有3大类 18 个功能,都是完全免费的。图片工具有转换图片、拼接图片、图片加水印、调整图片尺寸、裁剪图片、压缩图片、压缩jpg并保留exif、压缩图片到指定大小、读取exif、分割图片十个功能。图片转换支持将 pdf、psd、heic、raw、tiff 等60种以上的格式转换成常用的 jpg、webp、png。Gif工具有Gif压缩、Gif裁剪、从Gif中提取帧、Gif合并、Gif倒转、Gif转webp转apng6个功能。视频工具有视频转Gif,剪辑视频并转Gif两个功能。所有文件处理的操作也都是在浏览器本地进行,无需上传文件,不会上传图片到网站服务器,保障隐私,保证安全。

网址:imagestool.com/zh_CN/in

Squoosh

quoosh 是谷歌出品的一个图片压缩网站,免费使用,并且属于PWA应用,所以添加到设备上以后可以离线使用。

Squoosh 可以减小文件大小并保持高质量。Squoosh在本地完成所有工作,图像永远不会离开您的设备,不用担心隐私问题。

网址:squoosh.app/editor

快速增长的Mega期刊究竟是否等同掠夺期刊?还能投吗?

上月底,JAMA最新刊载了一篇viewpoint,探讨了近年来快速增长的巨型期刊(Mega期刊)。加之近期500本期刊被科睿唯安标记为On hold预警,其中不乏Mega期刊,从而让这一饱受争议的期刊类型再次被大家重视。究竟Mega期刊是不是等同于掠夺期刊?以后还能否在这类期刊上发文?今天我们就来综合解答一下。

原文链接:https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2802853
何为 Mega 期刊?
Mega期刊又叫巨型期刊或大型期刊,简单粗暴总结——发文量大、收录范围大、以收取高昂版面费居多的开源期刊。并且,巨型期刊与其他期刊很重要的一点区别在于,它是以科学可靠性而不是创新性或重要性作为同行评议的标准。近年来,巨型期刊在生物医学领域迅速增长。
根据JAMA的这篇文章我们可以看到,2022年,已有55个期刊的年发文量超过2000,其中生物医学类占比达到近四分之一。并且在生物医学研究领域,已有26本期刊年发文量超过3500。
Mega期刊的是如何诞生的?
由于电子期刊出版流程已趋于成熟,再加上开放获取(Open Access)的推广,促使OA出版模式成为另一种出版渠道。 同时,电子期刊出版流程改变,也让稿件的审稿模式产生了新的评议方式,文章收录数量不再像纸本期刊有文章篇数上的限制,出版商可据投稿数量轻松地扩大出版规模,藉由以上各种因素与环境的渠成,促成了Mega期刊的产生。
Mega期刊中,最知名的期刊就是PLoS One,其2022年的年发文量已高达15654篇,主题横跨科STM领域,打破了传统期刊著重于单一主题的收录范围。由于Mega期刊快速的出版模式,满足了特定群作者的需求,进而争取到更多的读者群。加之PLoS One的成功,后续引领许多知名出版社纷纷加入Mega期刊出版模式的行列中,例如SpringerPlus、Sage Open、BMJ Open等,这类Mega期刊的文章总出版量正在迅速增长中,同时也因稿件被接受的可预测性,吸引众多作者投稿时的目光。
Mega期刊是掠夺性期刊吗?
Mega期刊具有出版量大、快速出版和向作者收取APC等特点,这些刚好也是掠夺型期刊的特点,因此对于其是否属于掠夺性期刊一直饱受争议。
一方面,掠夺型期刊的争议点仍在于是以不合理高昂的APC、保证登刊等方式,欺瞒作者投稿,故不能简易的将Mega期刊与掠夺型期刊画上等号。 期刊质量仍须回归到各项评比因素,如主编群的专业声誉、出版商声誉、同侪审核的专业度与流程、是否收录于知名大型的索摘数据库如Web of Science、Scopus、Ei Compendex等。
Mega期刊虽然现在还不一定被判定为掠夺期刊,但我们不可否认的是,现实中一些巨型OA期刊采用相对较低的学术质量控制流程,批量出版以获取巨额盈利。因此也有学者认为一些大型开放获取期刊激进式的攫取经费方式,虽不是掠夺性的,但随着时间推移,按照目前的方法和增长率可能会使得他们转向为掠夺期刊。

让你的论文更“好看”|一些成熟的科研配色小建议

科研图片处理中有一个极易被忽视的加分项——配色。大多数作者可能都会选择黑白灰配色来完成自己的科研图片,虽然这样简洁不易出错,但不免显得单调。而如若能稍微在图片中添加一些色彩,说不定就能让编辑在海量的“黑白灰”中眼前一亮,产生好的第一印象。而我们也可以看到CNS这些顶刊的高分文章除了内容之外,配色方面往往也有诸多可取之处。今天我们就来为大家介绍一下,如何利用“图片配色”这个增分项让你的文章锦上添花。

科研图片的色彩要求

作图中常用的模式有两种,RGB 和 CMYK。RGB用于数码设备上,CMYK为印刷业通用标准,这两种对图片色彩的要求也是不尽相同的,多数期刊在Manuscripts Accepted for Publication阶段会要求图片为CMYK色彩。但现在很多期刊都是有网络版的,且RGB图比CMYK图表现出的效果好,色彩亮丽,更适合出现在网络上。而由RGB转变为CMYK模式容易,但是由CMYK模式转变为RGB模式,图象的表现力却会下降。所以有些期刊开始要求提供RGB的图。所以,我们在此建议大家,若投稿期刊未做要求,建议使用 RGB 模式,色彩表现力比较强,适合投稿后编辑和审稿人的阅读。

而对于不同类型的文章来说,图片的色彩要求标准也是不同的。例如,会议文章对图片质量的要求比较低,一般投了后基本都没有修改的机会,而杂志文章对图片质量的要求相当高,可能来回改几次才能满足要求。如果论文投稿前就达到了较高的质量,相信修改时会轻松很多。

科研图片的配色要点

彩图,用好了是加分项,用不好的话可能会适得其反。那么,如何让自己的图片配色不显得杂乱冲突呢?我们需要掌握好以下几个大的配色要点:

  • 同一篇文章的图片颜色要注意色调的整体性,不宜出现特别鲜明刺眼的颜色(尤其是荧光绿 XD)。
  • 同一张图片色系最好统一,看起来会更加协调。
  • 同一个指标在全篇图片中最好都使用同一个颜色贯彻始终。
  • 一般用红色表示上调,绿色/蓝色表示下调。
  • 可以用渐变色来表示程度,颜色越深越多,颜色越浅越少,能够使数据显示更加直观。

科研图片配色方案

让我们来跟着顶尖期刊Science,学一下高分论文的经典配色方案。

01

两色搭配

红黑搭配

一般红色用于重点数据线,黑色用于参考线。

 

图片来源:Awasthi et al., Science 363, 1483 (2019)

备注:取色块下标注的数字为该色的RGB色值,例如255,59,59,意为该色的红色值255,绿色值59,蓝色值59。

红蓝搭配

图片来源:Miri et al., Science 363, 7709 (2019)

02

三色搭配

经典搭配

往往用于平行实验数据,无须突出某一数据,比如重复实验、平行实验等等。

图片来源:Yanet al., Science 363, 88–91 (2019)

冷暖搭配

冷暖搭配可以形成数据对比。

图片来源:South et al., Science 363, 45 (2019)

03

多色搭配

图片来源:Bain et al., Science 363, 46–49 (2019)

图片来源:Science 2019-01-11期插图

图片来源:Miri et al., Science 363, 7709 (2019)

图片来源:Ni,P., Chabot, N.L., Ryan, C.J. etal. Heavy iron isotope composition of iron meteorites explained bycore crystallization.Nat.Geosci.(2020)

04

灰色搭配

灰色可以用来衬托主题,用作背景色、参考色。

衬托主色

图片来源:Harrison et al., Science 363, eaat6280 (2019) , 10.1126/science.aat6280

作背景色

图片来源:Lézine et al., Science 363, 177–181 (2019)

一些配色捷径工具

当然如果你实在不知道怎么配色,也可以借助一些实用小工具,比如我们之前在视频号中推荐过的配色网站colorspace。

网站提供了三种配色模式,调色板、渐变色、三色渐变,您可以生成调色板或从您选择的颜色创建漂亮的CSS渐变。

当我们在看期刊年发文量的时候,我们到底要看什么?

我们评价一本期刊的时候除了影响因子、审稿周期外,还有一个很重要的指标——发文量。如果一本期刊发文量太小,大家会觉得这本期刊要么不放心,要么是为了提高影响因子而刻意压低发文量;如果一本期刊发文量猛烈扩张难免会被打上圈钱“水刊”的烙印。那么,期刊的年发文量到底于什么有关,又有什么意义?今天我们就来详细解析一下。

期刊发文量与什么有关?

期刊年发文量就只指一本期刊一年内发布文章的数据。因此期刊的发文量大小肯定首先是与其出版周期相关的。期刊按出版周期分为周刊、旬刊、半月刊、月刊、双月刊、季刊、半年刊、年刊和不定期刊等。出版周期越短,期刊的年发文量自然也就越多。

同时,随着科技水平的不断提高,促使了各学科发文量逐年增加。有研究发现,近 10 年来各学科发文量随时间增长而增长,并且发文量与年份之间具正相关关。

除此之外,作为期刊运营的一种手段,很多期刊会刻意控制发文量的增减,以达到提升影响力或期刊质量的目的。

以上这些因素综合作用,导致了期刊年发文量的变化。

直接来说,期刊发文量增加,会产生下面这些影响

1、版面费增加,收入会增加;

2、知名度会相应增加,毕竟辐射的人群更广。

相应也可能会产生的负面影响:

1、文章质量可能会下滑,导致期刊在业界的地位下滑。

2、发文量还是影响因子的分母,如果没有特殊原因,发文量突然变大的期刊,后年的影响因子基本都会受影响。而由于第一点质量的影响,引用频次也会降低,因此会直接导致影响因子的降低。

期刊发文量多少对期刊的影响,要具体问题具体分析。一方面来看,随着我国对国内期刊的重视程度越来越高,部分优质期刊(头部的10%)也越来越受到国内研究学者的青睐。根据《中国科技期刊卓越行动计划实施方案(2019–2023年)》,就是要打造一批高起点、高标准的卓越科技期刊,因此这部分期刊扩大收稿范围和收稿量,对于国内研究者来说无疑是一个利好消息。另一方面,由于大部分期刊(尾部的50%)的影响力和学术能力不是很高,因此收稿范围和稿件质量受到了一定的限制,因此只能无奈增加一些质量不高的文章发表,从而提升自身的运营持续性和经济效益。
也正因为此,在过去国家监管不严的情况下就导致有些“水刊”一期能收三五百篇文章。但近几年国家严管了,所有正规的学术期刊必须确保每期文章数量要低于100篇(相应的如果你发现某个刊物超过这个数量,那这个刊物是存在很大的风险)。因此在这两年,刊物全年的发文量只会减少,一般不会增多。
当我们在看发文量的时候我们在看什么?
正如我们前文所说,如果一本期刊发文量太小,大家会觉得这本期刊要么不放心,要么是为了提高影响因子而刻意压低发文量;如果一本期刊发文量猛烈扩张难免会被打上圈钱“水刊”的烙印。那么我们从作者的角度出发,又该如何看待“发文量”的增减呢?
普通期刊增加发文量,从小白作者的角度看有一定积极意义。因为对于大部分入门阶段小白,一些发文量较大的普通期刊给作者提供了科研入门的经历和入口,对研究者逐步提升自身水平有一定的好处。
而另一方面,期刊影响因子并非由文章发文量决定,而是由直接引用次数、简介引用次数和引用范围决定。稿件量大的,影响因子不一定低,稿件量小的,影响因子也不一定高。因此我们在判断期刊的时候除了看发文量,还需要综合衡量一下期刊的文章质量。如果文章质量低但发文量大,那么这种期刊来年的影响因子势必会受影响,投递需谨慎。
综上所属,选择期刊我们不能单看某一指标,而是要综合来考量期刊是否符合自身的研究方向和学科定位,根据自身文章质量来匹配合适自己的期刊。